Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRM1P23921 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRM1P23921 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRM1P23921 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRM1P23921 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRM1P23921 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRM1P23921 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRM1P23921 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RRM1P23921 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRM1P23921 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRM1P23921 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRM1P23921 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRM1P23921 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRM1P23921 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRM1P23921 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRM1P23921 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRM1P23921 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRM1P23921 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRM1P23921 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RRM1P23921 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRM1P23921 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRM1P23921 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRM1P23921 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRM1P23921 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRM1P23921 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRM1P23921 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRM1P23921 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRM1P23921 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRM1P23921 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRM1P23921 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRM1P23921 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRM1P23921 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRM1P23921 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRM1P23921 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRM1P23921 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRM1P23921 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRM1P23921 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRM1P23921 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRM1P23921 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRM1P23921 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRM1P23921 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRM1P23921 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRM1P23921 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRM1P23921 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRM1P23921 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRM1P23921 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRM1P23921 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRM1P23921 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRM1P23921 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRM1P23921 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRM1P23921 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRM1P23921 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRM1P23921 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRM1P23921 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRM1P23921 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RRM1P23921 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRM1P23921 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRM1P23921 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRM1P23921 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRM1P23921 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRM1P23921 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRM1P23921 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRM1P23921 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRM1P23921 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RRM1P23921 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRM1P23921 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRM1P23921 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRM1P23921 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRM1P23921 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRM1P23921 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRM1P23921 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRM1P23921 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRM1P23921 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRM1P23921 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRM1P23921 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRM1P23921 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRM1P23921 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRM1P23921 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRM1P23921 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRM1P23921 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRM1P23921 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRM1P23921 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRM1P23921 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.3 ms