Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT1P21579 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT1P21579 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT1P21579 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT1P21579 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT1P21579 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT1P21579 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT1P21579 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT1P21579 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT1P21579 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT1P21579 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT1P21579 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT1P21579 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT1P21579 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT1P21579 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT1P21579 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT1P21579 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT1P21579 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT1P21579 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT1P21579 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT1P21579 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT1P21579 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT1P21579 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT1P21579 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT1P21579 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT1P21579 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT1P21579 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT1P21579 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT1P21579 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT1P21579 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT1P21579 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT1P21579 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT1P21579 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT1P21579 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT1P21579 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT1P21579 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT1P21579 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT1P21579 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT1P21579 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT1P21579 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT1P21579 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT1P21579 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT1P21579 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT1P21579 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT1P21579 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT1P21579 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT1P21579 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT1P21579 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT1P21579 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT1P21579 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT1P21579 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYT1P21579 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT1P21579 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT1P21579 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT1P21579 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT1P21579 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT1P21579 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT1P21579 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT1P21579 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT1P21579 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT1P21579 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT1P21579 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT1P21579 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT1P21579 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT1P21579 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT1P21579 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT1P21579 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT1P21579 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT1P21579 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT1P21579 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT1P21579 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT1P21579 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT1P21579 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT1P21579 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT1P21579 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT1P21579 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT1P21579 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT1P21579 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT1P21579 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT1P21579 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT1P21579 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT1P21579 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT1P21579 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT1P21579 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT1P21579 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYT1P21579 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT1P21579 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT1P21579 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT1P21579 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT1P21579 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT1P21579 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT1P21579 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT1P21579 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT1P21579 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT1P21579 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT1P21579 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT1P21579 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT1P21579 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT1P21579 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT1P21579 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms