Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1B2P21281 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6V1B2P21281 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms