Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCK1P16333 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCK1P16333 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCK1P16333 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCK1P16333 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCK1P16333 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCK1P16333 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCK1P16333 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCK1P16333 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCK1P16333 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCK1P16333 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCK1P16333 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCK1P16333 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCK1P16333 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCK1P16333 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCK1P16333 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCK1P16333 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCK1P16333 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCK1P16333 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCK1P16333 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCK1P16333 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCK1P16333 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCK1P16333 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCK1P16333 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCK1P16333 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCK1P16333 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCK1P16333 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCK1P16333 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCK1P16333 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCK1P16333 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCK1P16333 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCK1P16333 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCK1P16333 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCK1P16333 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCK1P16333 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCK1P16333 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCK1P16333 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCK1P16333 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCK1P16333 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCK1P16333 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCK1P16333 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCK1P16333 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCK1P16333 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCK1P16333 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCK1P16333 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCK1P16333 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCK1P16333 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCK1P16333 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCK1P16333 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCK1P16333 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCK1P16333 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCK1P16333 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCK1P16333 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCK1P16333 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCK1P16333 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCK1P16333 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCK1P16333 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCK1P16333 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCK1P16333 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCK1P16333 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms