Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GSPT1P15170 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSPT1P15170 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSPT1P15170 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms