Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT10P13645 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT10P13645 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT10P13645 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT10P13645 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT10P13645 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT10P13645 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT10P13645 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT10P13645 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT10P13645 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT10P13645 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT10P13645 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT10P13645 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT10P13645 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT10P13645 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT10P13645 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT10P13645 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT10P13645 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT10P13645 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT10P13645 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT10P13645 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT10P13645 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT10P13645 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT10P13645 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT10P13645 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT10P13645 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT10P13645 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT10P13645 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT10P13645 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT10P13645 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT10P13645 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT10P13645 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT10P13645 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT10P13645 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT10P13645 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT10P13645 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT10P13645 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT10P13645 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT10P13645 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT10P13645 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT10P13645 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT10P13645 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT10P13645 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT10P13645 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT10P13645 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT10P13645 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT10P13645 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT10P13645 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT10P13645 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT10P13645 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT10P13645 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT10P13645 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT10P13645 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT10P13645 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT10P13645 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT10P13645 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT10P13645 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT10P13645 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT10P13645 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT10P13645 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT10P13645 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT10P13645 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT10P13645 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT10P13645 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT10P13645 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT10P13645 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT10P13645 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT10P13645 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT10P13645 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT10P13645 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT10P13645 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT10P13645 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT10P13645 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT10P13645 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT10P13645 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT10P13645 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT10P13645 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT10P13645 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT10P13645 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT10P13645 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT10P13645 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT10P13645 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT10P13645 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT10P13645 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT10P13645 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT10P13645 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT10P13645 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT10P13645 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT10P13645 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT10P13645 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT10P13645 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT10P13645 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT10P13645 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT10P13645 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT10P13645 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT10P13645 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT10P13645 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT10P13645 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT10P13645 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT10P13645 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms