Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COX4I1P13073 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms