Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR35P0CG20 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRR35P0CG20 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR35P0CG20 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms