Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FREM3P0C091 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms