Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F13BP05160 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F13BP05160 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F13BP05160 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
F13BP05160 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F13BP05160 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F13BP05160 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F13BP05160 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F13BP05160 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F13BP05160 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F13BP05160 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F13BP05160 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F13BP05160 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F13BP05160 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F13BP05160 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F13BP05160 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
F13BP05160 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
F13BP05160 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
F13BP05160 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
F13BP05160 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F13BP05160 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F13BP05160 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F13BP05160 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F13BP05160 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F13BP05160 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F13BP05160 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F13BP05160 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F13BP05160 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F13BP05160 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F13BP05160 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F13BP05160 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F13BP05160 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F13BP05160 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F13BP05160 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F13BP05160 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F13BP05160 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F13BP05160 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F13BP05160 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F13BP05160 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F13BP05160 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F13BP05160 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F13BP05160 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F13BP05160 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13BP05160 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13BP05160 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13BP05160 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13BP05160 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13BP05160 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13BP05160 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13BP05160 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13BP05160 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13BP05160 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F13BP05160 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
F13BP05160 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F13BP05160 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F13BP05160 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
F13BP05160 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F13BP05160 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F13BP05160 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F13BP05160 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
F13BP05160 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F13BP05160 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F13BP05160 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F13BP05160 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
F13BP05160 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
F13BP05160 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F13BP05160 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
F13BP05160 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F13BP05160 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F13BP05160 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F13BP05160 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F13BP05160 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F13BP05160 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
F13BP05160 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F13BP05160 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13BP05160 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F13BP05160 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
F13BP05160 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F13BP05160 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
F13BP05160 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F13BP05160 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
F13BP05160 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
F13BP05160 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F13BP05160 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
F13BP05160 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F13BP05160 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
F13BP05160 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
F13BP05160 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms