Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TYMSP04818 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TYMSP04818 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TYMSP04818 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TYMSP04818 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TYMSP04818 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TYMSP04818 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TYMSP04818 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TYMSP04818 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TYMSP04818 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TYMSP04818 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TYMSP04818 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TYMSP04818 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TYMSP04818 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TYMSP04818 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TYMSP04818 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TYMSP04818 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TYMSP04818 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TYMSP04818 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TYMSP04818 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TYMSP04818 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TYMSP04818 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TYMSP04818 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TYMSP04818 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TYMSP04818 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYMSP04818 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYMSP04818 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TYMSP04818 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TYMSP04818 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYMSP04818 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYMSP04818 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYMSP04818 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TYMSP04818 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TYMSP04818 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYMSP04818 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYMSP04818 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TYMSP04818 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYMSP04818 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYMSP04818 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYMSP04818 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TYMSP04818 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TYMSP04818 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYMSP04818 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TYMSP04818 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TYMSP04818 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYMSP04818 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYMSP04818 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYMSP04818 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TYMSP04818 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYMSP04818 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYMSP04818 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYMSP04818 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TYMSP04818 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYMSP04818 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYMSP04818 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYMSP04818 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYMSP04818 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYMSP04818 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYMSP04818 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYMSP04818 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TYMSP04818 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYMSP04818 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYMSP04818 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYMSP04818 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYMSP04818 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms