Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND3P03897 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND3P03897 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MT-ND3P03897 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms