Protein–RNA interactions for Protein: P02538

KRT6A, Keratin, type II cytoskeletal 6A, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6AP02538 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT6AP02538 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT6AP02538 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT6AP02538 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms