Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLIC3O95833 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIC3O95833 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms