Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL3O95573 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms