Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN9O95484 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN9O95484 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms