Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC22BO75396 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC22BO75396 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC22BO75396 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC22BO75396 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms