Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC22O60826 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms