Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SORBS3O60504 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SORBS3O60504 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SORBS3O60504 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SORBS3O60504 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SORBS3O60504 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SORBS3O60504 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SORBS3O60504 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SORBS3O60504 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SORBS3O60504 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SORBS3O60504 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORBS3O60504 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORBS3O60504 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORBS3O60504 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SORBS3O60504 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SORBS3O60504 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORBS3O60504 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORBS3O60504 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORBS3O60504 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SORBS3O60504 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SORBS3O60504 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SORBS3O60504 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SORBS3O60504 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SORBS3O60504 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SORBS3O60504 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SORBS3O60504 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SORBS3O60504 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SORBS3O60504 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms