Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD51CO43502 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD51CO43502 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms