Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNAB3O43448 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNAB3O43448 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.3 ms