Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PJA2O43164 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PJA2O43164 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA2O43164 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA2O43164 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA2O43164 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA2O43164 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA2O43164 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA2O43164 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA2O43164 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PJA2O43164 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PJA2O43164 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PJA2O43164 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PJA2O43164 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PJA2O43164 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PJA2O43164 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PJA2O43164 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PJA2O43164 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PJA2O43164 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PJA2O43164 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA2O43164 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA2O43164 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA2O43164 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA2O43164 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA2O43164 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA2O43164 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA2O43164 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA2O43164 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PJA2O43164 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PJA2O43164 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PJA2O43164 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PJA2O43164 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PJA2O43164 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PJA2O43164 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PJA2O43164 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PJA2O43164 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PJA2O43164 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PJA2O43164 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PJA2O43164 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PJA2O43164 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PJA2O43164 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA2O43164 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA2O43164 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA2O43164 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA2O43164 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA2O43164 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA2O43164 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA2O43164 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA2O43164 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PJA2O43164 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PJA2O43164 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PJA2O43164 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PJA2O43164 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PJA2O43164 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PJA2O43164 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PJA2O43164 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PJA2O43164 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA2O43164 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PJA2O43164 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PJA2O43164 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PJA2O43164 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PJA2O43164 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PJA2O43164 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PJA2O43164 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PJA2O43164 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PJA2O43164 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PJA2O43164 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PJA2O43164 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PJA2O43164 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PJA2O43164 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PJA2O43164 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PJA2O43164 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PJA2O43164 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PJA2O43164 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PJA2O43164 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PJA2O43164 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PJA2O43164 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PJA2O43164 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PJA2O43164 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PJA2O43164 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PJA2O43164 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PJA2O43164 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PJA2O43164 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PJA2O43164 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PJA2O43164 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PJA2O43164 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PJA2O43164 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PJA2O43164 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PJA2O43164 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms