Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS3O14543 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms