Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF10AO00220 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF10AO00220 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF10AO00220 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF10AO00220 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms