Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB8E9PQR5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPIPB8E9PQR5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms