Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB11E5RHQ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB11E5RHQ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms