Protein–RNA interactions for Protein: C9J798

RASA4B, Ras GTPase-activating protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4BC9J798 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA4BC9J798 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA4BC9J798 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASA4BC9J798 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4BC9J798 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms