Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF25A6NGN4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms