Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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