Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNPO3Q9Y5L0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms