Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SHANK2Q9UPX8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHANK2Q9UPX8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms