Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms