Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB23Q9ULC3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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