Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPAN16Q9UKR8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms