Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LAMTOR3Q9UHA4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms