Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKLFQ9UBR5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms