Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLKQ9UBE8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms