Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.9 ms