Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC88CQ9P219 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms