Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK13-1Q9NX77 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK13-1Q9NX77 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms