Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms