Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms