Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CLSPNQ9HAW4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSPNQ9HAW4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms