Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRCIN1Q9C0H9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms