Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT23Q9C075 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT23Q9C075 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT23Q9C075 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT23Q9C075 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT23Q9C075 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT23Q9C075 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT23Q9C075 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT23Q9C075 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT23Q9C075 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT23Q9C075 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms