Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms