Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms