Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLVAPQ9BX97 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms