Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms