Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms